Bubble Witch 3 داستان جادوگری بزرگ به نام استلا است که با قدرت های ماواریی خود قصد مبارزه با شیطان خبیث را دارد زیرا او و گربه ی حیله گری به نام Wilbur، ارواح تاریک را در سرزمین رنگارنگ استلا پراکنده ساخته اند و اکنون نیاز به مهارت و کمک شماست تا استلا بتواند این ارواح را بیرون کند.با نشانه گیری های به سمت توپ های همرنگ و حذف آنها امتیاز بیشتری کسب کرده و با حذف عناصر تاریکی به مرحله ی بعد صعود کنید و اینگونه Wilbur را ناامید کنید و هر بار ناحیه ایی از قلمروی خود را از تاریکی ها پاک کنید.