در آکادمی انتقام جویان مارول باید به ساخت یک آکادمی مجهز  و قوی جهت پرورش انتقام جویان پرداخته و با مهیا کردن امکاناتی مثل خوابگاه، کلاس های درسی و حتی آزمایشگاههای تحقیق برای آنها به رشد و شکوفایی آن مرکز کمک کنید.در این بازی شخصیت هایی مثل مرد آهنی و زنبور، ثور، لوکی، کاپیتان آمریکا، بیوه سیاه، و هالک نیز به آکادمی پیوسته اند و برای مقابله با قهرمان شکست ناپذیری به نام هیدرا که حتی موفق به نابودی گروه S.H.I.E.L.D شده است، آمادگی لازم را کسب می کنند.